火影忍者手游中，五大仙术流派主要包括妙木山仙术、龙地洞仙术、木遁仙术、风遁仙术以及由忍者与通灵兽共同施展的组合仙术。
妙木山仙术体系以蛤蟆契约和听觉幻术为特色，其核心技能来自深作与志麻两位仙人。代表性技能有仙术·蛙鸣，这是一种强大的声音系幻术，能让对手陷入僵持。组合技舌战缚/水斩需要志麻仙人先用舌头束缚敌人，再由深作仙人吐出高强度水遁进行斩杀。而魔幻·蛤蟆临唱被誉为蛤蟆二重唱，是两大仙人合作的听觉系幻术，听完旋律的对手会被困在幻术结界中无法动弹，最终被石剑刺中。
龙地洞仙术则表现为更为诡谲的蛇系仙法，药师兜掌握的仙法·白激之术是其代表。该术会从口中吐出白色液体，化为长龙环绕龙珠旋转，龙珠爆裂产生强光和剧烈震动，能让区域内空气不断震动，导致受攻击者全身骨头摩擦、身体麻木，强光和声音还会损害对手的视觉与听觉。
木遁仙术以初代火影千手柱间的仙法木遁·真数千手最为震撼，这是体积最为庞大的仙术之一。施术后会制造出高于百米、拥有数千只巨臂的千手佛像，其规模远超九尾，在终结谷之战中曾用来对抗身穿须佐能乎铠甲的九尾，展现了仙术查克拉与木遁结合后的究极形态。
风遁仙术的巅峰是漩涡鸣人的仙法·风遁·奥义·阿修罗之螺旋手里剑。此术是鸣人仙人模式的最终绝技，融合了其标志性的螺旋丸、在妙木山习得的仙术、九尾之力以及六道之力，在终结谷一战中与因陀罗之矢的威力不相上下，体现了仙术查克拉对普通忍术的巨大强化效果。
组合仙术强调忍者与通灵伙伴的协同作战，自来也的仙法·五右卫门是典型。此术需要自来也吐出蛤蟆油，志麻仙人同步施展火遁，深作仙人加入风遁，三种术组合后能瞬间制造出覆盖战场的数千度滚油，理论上可吞噬一切有形物质，属于超S级的火遁组合忍术。
